As a admin I want to prepare geno data linked to pheno data

TracNav(MolgenisAppStories)?

Scrum: ticket:1052

How to demo:

• Genotype data can be converted from TriTyper? into PLINK format AND binary format (or binary format only?)
• Genotype data is filtered for only the selected Individuals
• Genotype data is linked to phenotype data using the study specific pseudonyms (of Individuals)

Pre-condition

• Marcel spreadsheet bevat LLPatient ID's en Marcel Pseudoniemen (gekoppeld).
• Genotype data is in TriTyper? format (???)
• LL PatientID's gaan niet van LRA naar Target Stage.
• Target Stage bevat LL bronpseudoniem.
• Voor onderzoek wordt LL bronpseudoniem vervangen door onderzoekpseudoniem.

Acceptance criteria

• Er is een lijst met onderzoekspseudoniem en Marcelpseudoniem (alleen voor de geselecteerde individuen!)
• Lijst gaat mee in data export/import naar CIT Publish (tijdelijk)
• Convertor leest TriTyper? format file, filtert op individuen, en schrijft weg naar PLINK met onderzoekspseudoniem